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Rでクラスター分析

　Rにはhclustというクラスター分析を行うための関数が用意されています。またデンドログラム（樹形図）を描くためのplclustという関数もありますが,plotを使用しても問題ありません。

-使用例

　methodには分類方法を指定します（下表を参照）。

ward	ウォード法
single	最短距離法
complete	最長距離法
average	群平均法
mcquitty	MaQuitty法
median	メディアン法
centroid	重心法

> data
      [,1] [,2]
 [1,]  156   80
 [2,]  162   77
 [3,]  150   76
 [4,]  175   70
 [5,]  170   65
 [6,]  171   67
 [7,]  180   56
 [8,]  178   52
 [9,]  181   60
> result<-hclust(dist(data),method="single")
> plot(result)

　また次のような関数を定義しておけば,データ行列を用意するだけでデンドログラムを描くことができる。分類方法を変えたければ,method="single"の部分を変えればよい。

myclust<-function(dat)
{
        d<-dist(dat)
        res<-hclust(d,method="single")
        windows()
        plot(res,ylab="距離",xlab="")
}